O Instituto Maria Auxiliadora dispõe de uma estrutura pensada para conforto e o bem-estar da cornunidade educativa: Recepção central e Recepção para os alunos, com serviço de som; Biblioteca e Multimeios (videoteca); Laboratórios de Química, Física e Biologia; Laboratórios de Informática com Internet Banda Larga; Salas de Projecão, Leitura, Artes e Xadrez, Teatro, Música, Ballet, Ex-alunas; Rádio IMA; Sala da Memória; Sala de Pastoral; Praça de Alimentação informatizada; Ginásios de Esportes; Espaço Poliesportivo (salão de jogos, salas de Karatê e Aeróbica, Judô, quadras de Tênis, Vôlei de praia, Futebol Society); Piscina infantil e Semi-olímpica; Pátios, Parques da Educação Infantil e do Fundamental, Recanto Azul – um espaço verde aberto para aula e lazer; Capela Nossa Senhora Auxiliadora e Gruta Nossa Senhora de Lourdes; Audítório e Salão Laura Vicuña (Hipermídia). Conta ainda com: uma Casa preparada com Salão, Quadra e Piscina para as Formações, os Encontros e as Reuniões, na Praia de Santa Rita, Ônibus e Sprinter para o translado e conforto dos nossos alunos e educadores.